利用者側では、Markdownに限らず、不審なファイルのリンクは安易にクリックしないよう注意する必要があります。その上で、シンプルだった頃のメモ帳を知っている人にとっては、「余計な」機能の追加が脆弱性を招いてしまった印象を受けるのではないでしょうか。