A small tool that answers one question: given the sequences you expected and what you actually sequenced (FASTQ), which references show up in your reads, and which don't? Upload your reference ...

This project implements a lightweight FASTA parsing and sequence quality-control workflow in pure Python and cross-validates the results with Biopython. GC percentage is a useful sequence-composition ...

この記事はすこし専門的な内容になっており、『生物学に特化した短編小説とエッセイ』とは別のマガジンに組み込まれています。 遺伝学とプログラミングに興味がある方はぜひ試してみてください。 ・fastaファイルに含まれる配列をアライメントして ...

NGS解析や遺伝子解析を行う際、FASTAファイルを染色体ごとに分割したい場面が多々あります。そこで、Pythonを使って簡単に染色体ごとにFASTAファイルを分割し、元のディレクトリに出力するスクリプトを作成しました。 このスクリプトは、染色体（または ...