九州大学 大学院医学研究院の沖 真弥助教と目野 主税 教授は、情報システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター（DBCLS）の大田 達郎 特任研究員などとの共同研究により、世界中から報告されたたんぱく質とゲノムDNAの結合情報 ...

クロマチン免疫沈降法（ChIP）に続いて次世代型の高処理能装置でタグ配列解読を行う方法（ChIP-seq）は、転写調節因子結合部位およびクロマチン修飾部位のマッピングに適した方法として、クロマチン免疫沈降法に続いてゲノムタイリングアレイ解析を行う ...

遺伝子のスイッチ役を「見える化」－バイオビッグデータを有効活用－ 九州大学大学院医学研究院の沖 真弥助教と目野 主税教授は、情報システム研究機構・ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)の大田達郎特任研究員などとの共同研究により ...

本研究開発課題では、ChIP－seqデータの統合解析データベース（ChIP－Atlas）のデータ追加と機能拡充を目指す。特に、Bisulfite－seqデータの追加、収集対象生物の拡充、サンプルメタデータに対するキュレーション業務 ...

体内時計による約24時間周期のリズムを生み出すゲノム配列を決定 ～ChIP-Seqデータから転写因子の認識DNA配列を決定する技術を開発～ 1.発表者: 深田 吉孝（東京大学大学院理学系研究科 生物科学専攻 教授） 吉種 光（東京大学大学院理学系研究科 生物科学 ...

高処理能配列解読データの分析にはさまざまな問題があるものの、それはシグナルの検出およびシグナルの評価という2つの一般的な問題の特別な例にすぎない。我々はシグナル処理理論の形式的に最適な解決策を応用し、ゲノムにマッピングされたDNA ...